腦科學(xué)重大突破 中國團隊實現(xiàn)斑馬魚全腦十萬級神經(jīng)元實時閉環(huán)研究

這一腦科學(xué)研究應(yīng)用領(lǐng)域的重大突破成果,由中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心杜久林研究員團隊、中國科學(xué)院自動化研究所蒿杰研究員團隊、中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心穆宇研究員團隊共同完成,已獲得授權(quán)發(fā)明專利“光學(xué)腦機接口系統(tǒng)和方法”,標(biāo)志著基于全腦單細(xì)胞光學(xué)成像的虛擬現(xiàn)實、光遺傳調(diào)控等技術(shù)在腦科學(xué)閉環(huán)研究領(lǐng)域的應(yīng)用邁出了關(guān)鍵一步。
在本項研究中,研究團隊借助天文學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)處理技術(shù),采用FPGA-GPU(現(xiàn)場可編程門陣列-圖形處理器)混合架構(gòu),成功對高達500MB/s(兆比特每秒)的大數(shù)據(jù)流神經(jīng)功能數(shù)據(jù)進行實時配準(zhǔn)、信號提取和分析。相關(guān)研究論文近日在國際專業(yè)學(xué)術(shù)期刊《自然-神經(jīng)科學(xué)》(Nature Neuroscience)發(fā)表。

研究團隊介紹說,全腦范圍單神經(jīng)元活動成像是解析大腦并行分布式計算原理的有力工具,但其巨大的數(shù)據(jù)實時處理需求已成為技術(shù)發(fā)展的瓶頸,導(dǎo)致難以實時分析以及在大尺度上閉環(huán)調(diào)控和研究腦功能。受天文學(xué)領(lǐng)域中快速射電暴檢測技術(shù)的啟發(fā),并借鑒其系統(tǒng)設(shè)計策略,本項研究利用FPGA編程的靈活性建立光學(xué)神經(jīng)信號預(yù)處理系統(tǒng),對來自光學(xué)傳感器的信號規(guī)整化,并將其發(fā)送給基于GPU的實時處理系統(tǒng),進行高速非線性配準(zhǔn),提取各信道的神經(jīng)信號,依據(jù)編碼規(guī)則進行解碼,以獲得用于控制外部器件的反饋信號。
其研究結(jié)果顯示,光學(xué)神經(jīng)信號預(yù)處理系統(tǒng)通過實時監(jiān)測斑馬魚全腦神經(jīng)元的活動,生成反饋信號,反饋間隔小于70.5毫秒。同時,該系統(tǒng)性能可在3個腦科學(xué)閉環(huán)研究場景下得到展示:
一是閉環(huán)實時光遺傳學(xué)神經(jīng)調(diào)控。通過功能聚類識別全腦神經(jīng)元集群,將選定集群的自發(fā)活動作為觸發(fā)信號,實施實時光遺傳學(xué)刺激于目標(biāo)神經(jīng)元集群。相對于開環(huán),閉環(huán)刺激有效激活了下游腦區(qū)。
二是鎖相的實時視覺刺激實驗。通過對藍(lán)斑去甲腎上腺素能系統(tǒng)活動的實時監(jiān)測,在表征動物清醒狀態(tài)的藍(lán)斑興奮時相上施加視覺刺激,觀察到大腦中其他神經(jīng)元的反應(yīng)更為強烈。這表明,大腦狀態(tài)可調(diào)節(jié)對視覺信息的處理,同時指出閉環(huán)感覺刺激有助于精確研究大腦內(nèi)部狀態(tài)與外界環(huán)境的相互作用。
三是全腦光學(xué)腦機接口實現(xiàn)的虛擬現(xiàn)實。實時將高維的全腦所有神經(jīng)元活動降維到多個神經(jīng)元集群的活動,并將任一集群的活動與視覺環(huán)境閉環(huán)聯(lián)接,建立基于光學(xué)成像、直接從腦神經(jīng)活動到視覺環(huán)境的虛擬現(xiàn)實系統(tǒng)。在該虛擬現(xiàn)實中,可以隨意調(diào)整神經(jīng)活動與環(huán)境耦合的增益,使控制環(huán)境的神經(jīng)元集群根據(jù)增益變化適應(yīng)性地調(diào)整其輸出。
研究團隊表示,依托大數(shù)據(jù)流的實時分析和高通量全腦成像技術(shù),他們未來將進一步研究篩選適合光學(xué)腦機接口的神經(jīng)群體活動特征,以揭示其機制,開發(fā)出更高效的光學(xué)腦機接口技術(shù),推進腦科學(xué)研究范式的發(fā)展。
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